最初於2006年1月在深圳證券交易所(簡稱深交所)正式掛牌啟動的新三板市場，原希望承接退市公司與STAQ、NET掛牌公司。(按：STAQ、NET系統是中國分別於1992年7月和1993年4月開始運行的法人股交易系統，由於在交易過程中，相當數量的個人違反兩系統規定進入市場，造成兩系統流通的法人股實際上已經個人化，1999年，兩系統停止交易，成為資本市場上歷史遺留的問題。)

自2013年擴大針對中關村科技園區試點內所有符合新三板條件的非上市股份有限公司，以進行股權代辦轉讓。由於掛牌企業均為高科技企業，不同於原轉讓系統內的退市企業，故稱為「新三板」，其主要其意義在於成本低，掛牌速度快，可使公司治理更加規範，並可流通套現、定向融資。只是，新三板難以抑制地超速發展，甚至被資本界形容為「放水養魚」。

截至2016年1月8日，新三板掛牌企業總數已達5,259家，是2014年底的約3.3倍，總股本達到3,018.46億股。

其中協議轉讓企業達4,111家，做市轉讓企業1,148家，目前正申報及待掛牌的企業還有2,184家。光1月8日一天，就有25家企業掛牌新三板，平均每月掛牌企業數目逾200多家。

特別是私募基金(PE)數量，從2014年的21支增到2015年的1,614支，融資額累計超過1,000億人民幣。

PE的管理公司頻繁融資，融資金額和動作引起了社會廣泛關注和質疑，終致股轉公司於2015年12月25日暫停了私募機構掛牌新三板，等待證監會政策進一步明朗。

截至2015年底，新三板掛牌公司總市值達2.46兆元人民幣，較2014年底4,591億元的總市值，年增長5.36倍，目前新三板市盈率達47.23倍；新三板機構投資者數量2.27萬戶，個人投資者19.86萬戶，分別為2014年底的4.84倍和4.52倍。

（本文節錄自《環球生技月刊》2016年1&2月合刊號 http://www.gbimonthly.com/）